Satine, к сожалению, вопрос задан несколько неполно... Вы имеете ввиду тональность, технологию, или процесс настройки?
Если у вас есть подвижные пробки - просто передвигаете их до нужного тона вверх-вниз какой-нибудь палочкой, если трубки не открыты с обеих сторон, то можно использовать какой-то пластичный материал (воск, пластилин) и делать так:
http://www.preda-panflute.ro/en/maintenance.html
Это можно делать либо на слух, либо с тюнером...
Обычная гамма - соль-мажор...